צה"ל הקים שלושה מתחמים סמוך לגבול רצועת עזה – בבסיס רעים, במעבר כרם שלום ובמעבר ארז – לקליטת החטופים שישוחררו על ידי חמאס במסגרת הסכם הפסקת האש. החטופים יגיעו לאחד משלושת האתרים בהתאם לנתיב שחרורם.

במתחמים יפגשו החטופים צוותי צה"ל הכוללים רופאים, פסיכולוגים וקציני בריאות הנפש, ולאחר מכן יועברו ברכבים או במסוקים לבתי חולים בישראל, שם ייפגשו עם בני משפחותיהם.

במקביל, צה"ל נערך לנסיגה הדרגתית מהרצועה בהתאם להסכם. צה"ל גיבש תוכנית הגנה מחודשת בעוטף עזה, במסגרתה יהיה מערך הגנה מוגבר יותר בגבול הרצועה.

בהתאם להסכם, אוגדה 99 תצא באופן מדורג ממסדרון נצרים, בעוד אוגדה 162 תתפוס את ההגנה במרחב צפון עוטף עזה. אוגדת עזה תהיה אחראית על מרחב דרום העוטף. כלומר: צה"ל נשאר במרחב הרצועה עם שתי אוגדות בלבד.

בשלב הראשון, לא תותר חזרת אזרחים פלסטינים לאזורים שבהם יש לצה"ל נוכחות צבאית. כמו כן, בצה"ל הבהירו כי "כל איום על כוחותינו ייענה בצורה אגרסיבית".

בגדה המערבית, צה"ל מתגבר כוחות ומגביר כוננות לקראת שחרור אסירים פלסטינים כחלק מההסכם. הכוחות מתמקדים באבטחת צירי תנועה ובמעקב אחר ערים וכפרים פלסטיניים כדי למנוע התפרעויות או הפרות סדר.