אחרי ששר הביטחון ישראל כ"ץ תקף את הרמטכ"ל בשל העיכוב בהשלמת תחקירי המלחמה, נמסר מהצבא ש"צה"ל מנהל מערכת תחקירים מקיפה לשיפור ההגנה על המדינה ואזרחיה. התחקירים מתקדמים לפי עומס הלחימה – המפקדים שמנהלים את הקרבות הם גם אלה שמבצעים את התחקירים. קשב פיקודי חסר בלחימה עלול לעלות בחיי אדם".

בהתייחס לביקורת של כ"ץ על שיתוף הפעולה של הצבא עם מבקר המדינה נמסר ש"צה"ל משתף פעולה באופן מלא עם מבקר המדינה, למרות שמעולם לא נערכה ביקורת כזו במהלך מלחמה. כבר בימים אלה מתקיימות 18 ביקורות מבקר בצה"ל".

לגבי קצב עריכת התחקירים נמסר מצה"ל ש"תחקירים איכותיים הם בסיס חשוב מאוד ללמידה וביקורת המבקר. התחקירים יועברו למבקר בשקיפות מלאה בסיומם. צה"ל מחויב לאיכות התחקירים לפני מהירות עשייתם ויעשה הכול לסיימם באופן מקצועי מהר ככל שניתן".

עוד נכתב בהודעת הצבא ש"לשכת הרמטכ"ל והרמטכ"ל לא המליצו לאף גורם צבאי לפנות לייעוץ משפטי. זהו הליך קבוע של הסנגוריה הצבאית, שביצעה אותו מתוקף תפקידה ועצמאותה מבלי צורך לבקש לכך אישור. נדגיש כי לא ישב אף משפטן בתחקירי צה"ל ואף לאנשי הפרקליטות הצבאית אסור לנכוח על פי חוק חיסיון התחקיר".

בצה"ל מתחו ביקורת על ההודעות הפומביות של כ"ץ נגד הצבא: "פתרון הסוגיות צריך להתקיים בשיח בין שר הביטחון לרמטכ"ל ולא דרך התקשורת".